Apsces mozga mogu izazvati mnogobrojni infektivni organizmi među kojima prevladavaju anaerobi (uzročnici koji se razmnožavaju u uvjetima bez kisika).
Zbog morfološke građe, slabe prokrvljenosti i nedostatka kisika, apsces je teško liječiti antibioticima koji su inače lijekovi prvog izbora. Kirurška drenaža primjenjuje se kod inkapsuliranih apscesa koji se ne povlače ili uzrokuju povećanje intrakranijalnog tlaka. Smrtnost od apscesa mozga je velika, a kod preživjelih zaostaju teške neurološke posljedice. Kod kompliciranih slučajeva moždanih abscesa kod kojih se u liječenju ne može primijeniti kirurški zahvat, preporuča se HBOT, osobito stoga što je bakterijska flora uglavnom anaerobna.
HBOT smanjuje edem mozga, ima baktericidni učinak, djeluje sinergijski s antibioticima i pojačava obrambeni mehanizam organizma.
